COMPOSIZIONE DEL MICROBIOTA INTESTINALE IN PAZIENTI CON INFEZIONE DA HIV

In this project, we characterized the composition of gut microbiota in HIV-infected patients receiving antiretroviral therapy; for the analysis of the intestinal metagenome, the fecal samples of 15 HIV+ patients were subjected to extraction and purification of total DNA, which was sequenced with Illumina platform, that allows for a taxonomic classification by analyzing the V3-V4 hypervariable regions of the 16S gene (rRNA). The aim of the study is to highlight the potential relationship between inflammatory state and gut composition in HIV+ patients, evaluating the enrichment/riduction of certain taxa and the increase of inflammatory indices. We also want to analyze any taxa differences between groups, identified based on the total number of CD4+ T lymphocytes and the anrtiretroviral therapy.

In questo progetto, si caratterizza la composizione del microbiota intestinale in pazienti con infezione da HIV riceventi terapia antiretrovirale; per l’analisi del metagenoma intestinale, i campioni fecali dei 15 pazienti HIV+ sono stati sottoposti a estrazione e purificazione del DNA totale per poi effettuare il sequenziamento mediante piattaforma Illumina, che permette una classificazione tassonomica mediante l'analisi delle regioni ipervariabili V3-V4 del gene 16S (rRNA). Lo scopo dello studio è quello di evidenziare una potenziale relazione tra lo stato infiammatorio e la composizione del microbiota intestinale in pazienti HIV+, valutando l’arricchimento/riduzione di determinati taxa e l’aumento degli indici infiammatori. Stratificando i pazienti in base alla conta totale di linfociti T CD4+ e in base alla terapia antiretrovirale, si vuole, inoltre, analizzare le eventuali diversità, in termini di phyla e generi, che sussistono tra i vari gruppi.