Si è partiti dal quesito se il dominio KRAB-like/TRIM33 negli actinopterigi e il complesso FiNZ-ZNF (FZNF) nei ciprinidi fossero, nei proprio lignaggi, dei sostituti di KRAB-ZFP/TRIM28 dei sarcopterigi nel controllo della trascrizione degli elementi trasponibili. Prima di tutto, si è fornita la definizione degli elementi trasponibili e la loro classificazione e, successivamente, una descrizione delle proteine a dita di zinco e del complesso KRAB-ZFP. Sono stati condotti poi una serie di esperimenti, tra cui: il confronto tra il dominio KRAB e i domini KRAB-like/FiNZ e interazione di TRIM33 con le protein ZNF KRAB-like e FiNZ-ZNF, il contributo trascrizionale degli TE durante lo sviluppo dello zebrafish, l’espressione dei geni coinvolti nei meccanismi di silenziamento degli TE durante lo sviluppo dello zebrafish, le analisi di correlazione di Pearson e le analisi filogenetiche. Si è arrivati alla conclusione che solo il complesso KRAB-like/TRIM33 degli actinopterigi sia analogo a KRAB-ZFP/TRIM28 dei sarcopterigi.

L’importanza delle proteine a dita di zinco associate al Krüppel box nella trascrizione degli elementi trasponibili

GIORDANI, ERICA
2024/2025

Abstract

Si è partiti dal quesito se il dominio KRAB-like/TRIM33 negli actinopterigi e il complesso FiNZ-ZNF (FZNF) nei ciprinidi fossero, nei proprio lignaggi, dei sostituti di KRAB-ZFP/TRIM28 dei sarcopterigi nel controllo della trascrizione degli elementi trasponibili. Prima di tutto, si è fornita la definizione degli elementi trasponibili e la loro classificazione e, successivamente, una descrizione delle proteine a dita di zinco e del complesso KRAB-ZFP. Sono stati condotti poi una serie di esperimenti, tra cui: il confronto tra il dominio KRAB e i domini KRAB-like/FiNZ e interazione di TRIM33 con le protein ZNF KRAB-like e FiNZ-ZNF, il contributo trascrizionale degli TE durante lo sviluppo dello zebrafish, l’espressione dei geni coinvolti nei meccanismi di silenziamento degli TE durante lo sviluppo dello zebrafish, le analisi di correlazione di Pearson e le analisi filogenetiche. Si è arrivati alla conclusione che solo il complesso KRAB-like/TRIM33 degli actinopterigi sia analogo a KRAB-ZFP/TRIM28 dei sarcopterigi.
2024
2026-02-16
The relavance of Krüppel box-associated zinc finger proteins in the trascription of transposable elements
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.12075/25307